Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
VAMP8Q9BV40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms