Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms