Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3RQ99062 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CSF3RQ99062 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms