Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CRBNQ96SW2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRBNQ96SW2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms