Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PGAM5Q96HS1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PGAM5Q96HS1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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