Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SGF29Q96ES7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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