Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW6

SLC7A6OS, Probable RNA polymerase II nuclear localization protein SLC7A6OS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A6OSQ96CW6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC7A6OSQ96CW6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms