Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms