Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MS4A15Q8N5U1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms