Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms