Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLIP4Q8N3C7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms