Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PARP8Q8N3A8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms