Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACAD11Q709F0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACAD11Q709F0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms