Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF7Q6Q0C0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms