Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PXDC1Q5TGL8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PXDC1Q5TGL8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms