Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TDRD12Q587J7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms