Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms