Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms