Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TWISTNBQ3B726 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms