Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DBN1Q16643 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DBN1Q16643 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms