Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXT1Q16394 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms