Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RYR3Q15413 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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