Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAPTM4AQ15012 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAPTM4AQ15012 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms