Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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