Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SLC10A1Q14973 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms