Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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