Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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