Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX6Q13608 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PEX6Q13608 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PEX6Q13608 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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