Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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