Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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