Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms