Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE4DQ08499 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms