Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBXN1Q04323 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN1Q04323 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms