Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CENPEQ02224 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms