Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MC1RQ01726 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms