Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCQ00610 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms