Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK3Q00526 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms