Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MAT1AQ00266 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms