Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSPHP78330 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSPHP78330 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms