Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNRPNP63162 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms