Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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