Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARF3P61204 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARF3P61204 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms