Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms