Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAP25P60880 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms