Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB15P59190 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB15P59190 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms