Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA9P57773 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms