Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPD52P55327 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TPD52P55327 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TPD52P55327 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TPD52P55327 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TPD52P55327 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms