Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HIRAP54198 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIRAP54198 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms