Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMARCA4P51532 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms