Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RGS4P49798 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms